CRISPR 기반 유전자 교정 결과의 체세포 클론 확장 시 발생하는 비표적 편집(Off-target Editing) 위험도 평가 방법론 비교

체세포 유전자 치료에서 CRISPR 기술을 활용하여 원하는 유전자를 교정한 후, 해당 세포주의 성공적인 확장을 위해서는 높은 수준의 안전성 확보가 필수적이며, 이때 발생하는 비표적 편집은 주요 위험 요소이다.

위험도 평가 프레임워크의 차이

• 서열 기반 예측 모델 (In Silico Prediction): 가장 흔한 접근법으로, 타겟 서열과 유사도가 높은 잠재적 비표적 부위를 계산한다. 그러나 이는 실제 생체 내 환경을 완벽히 반영하지 못한다는 한계가 있다.
• 고처리량 스크리닝 (High-throughput Screening): GUIDE-seq나 CIRCLE-seq와 같은 실험적 방법은 실제로 편집된 모든 비표적 부위를 찾아내지만, 비용과 시간 소모가 크다는 단점이 있다.

최근에는 두 방법을 융합하거나, 유전자 편집 효율과 편집 잔류율을 동시에 측정하는 시스템 생물학적 접근법들이 도입되고 있으며, 이는 단순 서열 유사성 점수보다 더 현실적인 안전성 지표를 제공하려 한다. 궁극적으로는 정밀의료 적용 전, 각 환자 맞춤형 세포주에 최적화된 유전자 가위의 재설계 필요성이 제기된다.